Innehåll

• Programvaruöversikt
• Stödda filtyper
• Primär filtillägg
• Andra filtillägg som används av Integrated Genome Browser 9

Version (från och med 6/29/2016)	9
plattformar
Licens	Öppen källa
Kategori	Vetenskaplig

Mer info (besök utgivarens hemsida)

Betyg: 2.8 / 5 (6 Röster)

Programvaruöversikt

Viktigaste egenskaper

• Stöder olika genomformat som GenBank och FASTA
• Interagera med data med zoomning och panorering animeringar
• Få tillgång till och ladda genoom från QuickLoads webbplatser
• Överför data till olika grafformar
• Dela data med medarbetare via Dropbox
• Installera plugins för ytterligare funktionalitet

Integrerad Genome Browser (IGB) är ett open source-program som används för att visa och utforska stora genomiska dataset. Du kan visa olika dataformat, interagera med dina data, skapa grafik, spara information som bilder och dela data med medarbetare.

IGB tillåter dig att visa data från annoteringar och inriktade sekvenser. Programmet stöder en mängd olika format som FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband och GenBank. Du kan ta data och omvandla den till en mängd olika grafformer, inklusive felparametrar för att markera dataskillnader och djupdiagram för att visa täckning. Du kan också interagera med dina data via IGB: s zoomnings- och panoreringanimationer.

IGB ger dig tillgång till och laddar genomer från QuickLoads webbplatser, vilka är enkla system för kataloger, sekvenser och andra datafiler för visualiseringsändamål. IGB erbjuder avancerad funktionalitet med plugin support för att lägga till funktionalitet och arbetsflödesautomatisering genom att använda skript. IGB ger dig också avancerade funktioner för att dela dina data, oavsett om det publiceras som en högkvalitativ JPEG, PNG eller SVG-bild eller lagrar data i Dropbox för att ge dina medarbetare tillgång till ditt projekt.

IGB används främst av universitetsforskare, biologer och bioinformatiker. Det tillhandahåller avancerade verktyg för att öppna en mängd genomsättningsformat, visualisera data som olika grafer och dela data med medarbetare. Tyvärr är programmet beroende av bidrag för fortsatt utveckling, vilket innebär att stöd till ansökan kan upphöra när som helst. Integrerad Genome Browser är dock fortfarande ett kompetent, anpassningsbart program för användare som vill utforska och analysera deras genomdata.

Stödda filtyper

Primär filtillägg

.XML - XML-fil

Andra filtillägg som används av Integrated Genome Browser 9

Stödda filtyper
.SÄNG	UCSC BED Annotation Track File
.DAS	DeltaMaster Analysis Session
.FA	FASTA formaterad sekvensfil
.FAS	FASTA sekvensfil
.FASTA	FASTA sekvensfil
.GB	GenBank Data File
.SGR	SGR Genome Data File
.USEQ	USeq Genome Data File